Natutralmente distruggete entrambi la precedente lettera.
Se io fossi il locatore non farei una cosa del genere.
Perché non potrei avere la certezza che il conduttore non abbia conservato una fotocopia della lettera precedente, da lui scritta, firmata e fotocopiata prima di spedirla.
Vedo un rischio non per quanto riguarda l'Agenzia delle Entrate, ma proprio per i rapporti col conduttore.
Se, malgrado la disdetta, il conduttore non va via e occorre sfrattarlo per finita locazione (o per morosità), lui potrebbe esibire al giudice la prima lettera diversa per data e contenuto da quella successiva.