Certo che puoi.
L'affittacamere è un'attività che si svolge in forma imprenditoriale, mentre non lo è quando un privato affitta due camere della propria abitazione.
Unica cosa a cui dovrai fare attenzione è il fatto che se il reddito degli affitti supera quello catastale della tua abitazione non avrai più diritto alla deduzione IRPEF.
Per maggiori chiarimenti vedi i thread simili a questo già dibattuti in questo forum.
Ti riepilogo:
Per quanto riguarda l'IRPEF, dalle istruzioni di Unico PF 2011.
"Per l’abitazione principale è prevista una deduzione dal reddito complessivo di un importo fino all’ammontare della rendita catastale dell’unità immobiliare stessa e delle relative pertinenze."
E più avanti...
"..se l’unità immobiliare è utilizzata come abitazione principale ed una parte è concessa in locazione, la deduzione dal reddito complessivo, rapportata alla quota di possesso, spetta soltanto se, dopo aver effettuato il confronto tra la rendita di colonna 1 (reddito catastale rivalutato) e l’importo di colonna 5 (canoni di locazione ridotti del 15%), l’unità è assoggettata a tassazione sulla base della rendita catastale, ovvero l'importo di colonna 1 è maggiore di quello di colonna 5."
Per l'ICI:
Visto che il Dlgs 504/92 istitutivo dell'ICI non specifica il caso di locazione parziale della abitazione principale, ma si limita a definire "intendendosi per tale, salvo prova contraria, quella di residenza anagrafica" e poi... "Per abitazione principale si intende quella nella quale il contribuente, che la possiede a titolo di proprietà, usufrutto o altro diritto reale, e i suoi familiari dimorano abitualmente.", la detrazione per la prima casa è sempre possibile nei casi di cui sopra, anche qualora una parte di essa sia locata.