Secondo me si applica la regola dell'annualità successiva, ossia non c'è il "minimo".Si tratta e si applica la regola della annualità successiva, o visto che di fatto è la prima registrazione imponibile per caso Agenzia delle Entrate chiede il minimo?
Per l'Agenzia delle Entrate il versamento (dell'imposta di registro, in caso di regime IRPEF ordinario) per la prima annualità non può essere inferiore a 67 euro.
Schede - Registrazione di un nuovo contratto - Quanto si paga - Agenzia delle Entrate
Quanto si paga
www.agenziaentrate.gov.it
Se in una qualsiasi annualità successiva cambia il regime da ordinario a cedolare secca o viceversa, si tratta pur sempre di un'annualità successiva (seconda, terza, ecc; non la prima!) di quel contratto di locazione.
A me sembra molto chiaro, ma se ti rimangono dei dubbi puoi rivolgere la domanda all'Agenzia delle Entrate per mail. Qui a Torino sono abbastanza gentili, penso che ti risponderebbero.